Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GGTLC3B5MD39 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GGTLC3B5MD39 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GGTLC3B5MD39 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GGTLC3B5MD39 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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