Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PALM2-AKAP2B1ALY0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms