Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A6NL46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NL46 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NL46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NL46 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NL46 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NL46 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NL46 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NL46 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A6NL46 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NL46 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NL46 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NL46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NL46 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NL46 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NL46 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NL46 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A6NL46 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NL46 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NL46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NL46 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NL46 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A6NL46 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NL46 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NL46 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A6NL46 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NL46 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NL46 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NL46 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NL46 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NL46 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NL46 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A6NL46 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A6NL46 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A6NL46 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A6NL46 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A6NL46 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
A6NL46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NL46 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NL46 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NL46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NL46 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A6NL46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NL46 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NL46 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NL46 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NL46 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A6NL46 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NL46 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NL46 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NL46 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NL46 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NL46 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NL46 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A6NL46 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NL46 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NL46 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A6NL46 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NL46 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NL46 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NL46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NL46 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A6NL46 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A6NL46 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A6NL46 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A6NL46 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A6NL46 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A6NL46 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A6NL46 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
A6NL46 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A6NL46 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A6NL46 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A6NL46 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NL46 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NL46 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NL46 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A6NL46 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NL46 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NL46 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NL46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A6NL46 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NL46 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NL46 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A6NL46 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NL46 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NL46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NL46 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A6NL46 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NL46 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NL46 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NL46 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A6NL46 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NL46 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NL46 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NL46 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A6NL46 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NL46 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NL46 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NL46 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A6NL46 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms