Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TLCD2A6NGC4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLCD2A6NGC4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLCD2A6NGC4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLCD2A6NGC4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLCD2A6NGC4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD2A6NGC4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD2A6NGC4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD2A6NGC4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD2A6NGC4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD2A6NGC4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TLCD2A6NGC4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLCD2A6NGC4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLCD2A6NGC4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLCD2A6NGC4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms