Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MAP1LC3B2A6NCE7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MAP1LC3B2A6NCE7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MAP1LC3B2A6NCE7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms