Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNOT1A5YKK6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNOT1A5YKK6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNOT1A5YKK6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT1A5YKK6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT1A5YKK6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms