Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX4

SHISA3, Protein shisa-3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA3A0PJX4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA3A0PJX4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHISA3A0PJX4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHISA3A0PJX4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHISA3A0PJX4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms