Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
E2F8A0AVK6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E2F8A0AVK6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2F8A0AVK6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2F8A0AVK6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms