Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RASSF2-202ENST00000379400 5427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM13B-202ENST00000420893 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AL117258.1-201ENST00000637218 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DCTN1-202ENST00000394003 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 BACH2-202ENST00000343122 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ETV1-206ENST00000405218 3391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ERMAP-203ENST00000372517 3423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AP3B2-203ENST00000535359 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D8B-206ENST00000481617 4098 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCA17P-204ENST00000494925 3478 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP11B2-201ENST00000323110 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ETFB-202ENST00000354232 3551 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL6-202ENST00000393382 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC35A4-202ENST00000514199 3617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SYT2-201ENST00000367267 7614 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTN4-205ENST00000427331 4980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC32-203ENST00000407242 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MTMR4-201ENST00000323456 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PITX2-213ENST00000616641 3102 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR81-201ENST00000309182 3808 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 TNS1-202ENST00000310858 1792 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GAPVD1-219ENST00000495955 5309 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR176-202ENST00000543580 1755 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MYRIP-210ENST00000539167 4635 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FGD3-202ENST00000375482 3321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF304-204ENST00000598744 3331 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 BARD1-210ENST00000613374 4096 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NAGA-202ENST00000402937 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PITRM1-202ENST00000380989 3487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 IFT122-210ENST00000504021 3541 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 BEND3-202ENST00000429433 6654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 FHAD1-206ENST00000375998 4355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 AL136295.4-201ENST00000561419 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC24A4-205ENST00000532405 9950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CC2D2A-202ENST00000424120 5249 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 C17orf75-201ENST00000225805 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KRTAP9-9Q9BYP9 LY6G6D-223ENST00000375825 402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms