Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAMTA1Q9Y6Y1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms