Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN6Q9Y6Q1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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