Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HSPB11Q9Y547 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms