Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFE2L3Q9Y4A8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms