Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SHOC2Q9UQ13 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SHOC2Q9UQ13 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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