Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDHA12Q9UN75 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCDHA12Q9UN75 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms