Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP18Q9UMW8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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USP18Q9UMW8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP18Q9UMW8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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