Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCAN3Q9UKA8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCAN3Q9UKA8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms