Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRBP1Q9UHY1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRBP1Q9UHY1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms