Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCF2Q9UG63 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms