Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPG2Q9UBF2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms