Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP5Q9NZZ3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP5Q9NZZ3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms