Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EHD3Q9NZN3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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