Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSHZ2Q9NRE2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms