Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1Q9HCU9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1Q9HCU9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms