Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ELL3Q9HB65 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms