Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKRIP1Q9H875 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKRIP1Q9H875 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms