Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms