Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIL1Q9H173 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms