Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LNPKQ9C0E8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LNPKQ9C0E8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms