Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BCO2Q9BYV7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms