Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MESP1Q9BRJ9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MESP1Q9BRJ9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms