Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUBA1CQ9BQE3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms