Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAT1Q99536 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms