Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRERF1Q96PN7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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