Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC7Q96M83 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC7Q96M83 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms