Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BICD1Q96G01 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BICD1Q96G01 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms