Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM3DQ96BQ1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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