Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELBQ8NG08 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms