Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIK3C3Q8NEB9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms