Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM87AQ8NBN3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms