Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC149Q6ZUS6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms