Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00299Q6ZSB3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00299Q6ZSB3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms