Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC137Q6PK04 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC137Q6PK04 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms