Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRT80Q6KB66 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT80Q6KB66 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms