Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CLQ60I27 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms