Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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