Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF20Q5VTR2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF20Q5VTR2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms