Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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