Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC153Q494R4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms