Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms